119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0593 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 332 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  29.9 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  33.57 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  34.72 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  38.52 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  29.81 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.65 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  34.53 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  35 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  32.69 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  31.39 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  26.97 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.25 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  34.78 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  29.32 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  35.56 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  27.07 
 
 		 266 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  38.46 
 
 		 845 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  37.29 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  34.29 
 
 		 948 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  37.82 
 
 		 113 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  25.99 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  33.87 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.07 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  32.28 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  31.06 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  32.74 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  28.06 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  35.07 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  35.19 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0367  copper amine oxidase domain protein  30.87 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  31.72 
 
 		 481 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  27.84 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  31.43 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  36.04 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  32.73 
 
 		 792 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  37.17 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  29.37 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 		 418 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.51 
 
 		 907 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  31.21 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  29.73 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  32.56 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  28.83 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  32.06 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.26 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  30.32 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  30.82 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  29.11 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  33.91 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  34.23 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  34.96 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  30.71 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  28.97 
 
 		 718 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  30.36 
 
 		 704 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  32.28 
 
 		 521 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  29.73 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  33.62 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  29.03 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  32.71 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  24.91 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  29.37 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  32 
 
 		 758 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  29.05 
 
 		 732 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  30.06 
 
 		 950 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  35.14 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  28.7 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  26.03 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  28 
 
 		 529 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.1 
 
 		 447 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  32 
 
 		 1118 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  29.32 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  39.22 
 
 		 763 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  29.09 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  41.18 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  33.04 
 
 		 625 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  29.67 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  30.4 
 
 		 754 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 		 547 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  25.95 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  26.02 
 
 		 763 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  30.13 
 
 		 229 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  26.67 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 784 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  27.03 
 
 		 554 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  26.03 
 
 		 549 aa  47  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  27.75 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  27.83 
 
 		 465 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 		 650 aa  46.2  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>