174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0244 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0244  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0246  lytic transglycosylase, catalytic  97.97 
 
 		 197 aa  360  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1311  lytic transglycosylase, catalytic  53.74 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1089  lytic transglycosylase catalytic  40.1 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1014  lytic transglycosylase catalytic  31.05 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.316435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  34.81 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0365  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  33.98 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  34.62 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0364  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  28.38 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  25.17 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  32.81 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1297  lytic transglycosylase, catalytic  34.26 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2563  Lytic transglycosylase catalytic  34.26 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0148918  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 438 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  36.63 
 
 		 677 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2659  Lytic transglycosylase catalytic  34.26 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.725375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  34.31 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  27.81 
 
 		 798 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  33.82 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  27.27 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 442 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  29.84 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  28.19 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  30.47 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3239  Lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  34.86 
 
 		 648 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 663 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  26.53 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 		 251 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  26.81 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  26.53 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  30 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  30.93 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1319  lytic transglycosylase, catalytic  23.57 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  28.68 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  26.09 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  27.54 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.85 
 
 		 645 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  25.76 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 		 429 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  26.9 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 763 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 763 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  34.38 
 
 		 830 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 643 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  25.93 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  28.78 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  30.88 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  33.58 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  31.11 
 
 		 261 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  24.87 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  27.74 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  25.19 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0766  lytic transglycosylase, catalytic  29.03 
 
 		 354 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  31.11 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  29.01 
 
 		 664 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  24.22 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 		 730 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  26.43 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 		 730 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  26.09 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  28.57 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  32.35 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  29.41 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  25.31 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  28.47 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  30.3 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>