More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3239 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3239  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 
216 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  34.73 
 
 
166 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  43.12 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 
272 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  35.54 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  35.77 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  39.29 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.38 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.13 
 
 
226 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  31.21 
 
 
293 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4448  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 
283 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  39.32 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  39.32 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  32.91 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  40.17 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  40.17 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  39.32 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  34.71 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  41.44 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  39.32 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  33.93 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 
709 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  35.85 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  38.46 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6207  Lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287429  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  37.72 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.61 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.59 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  36.75 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 
603 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.07 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  37.24 
 
 
698 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  37.04 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  35.34 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  36.45 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  37.39 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  37.29 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  37.61 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  33.59 
 
 
709 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  35.34 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  34.75 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.4 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  37.5 
 
 
260 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 
154 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  37.29 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  31.19 
 
 
438 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1002  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 
271 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578014  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  33.03 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.47 
 
 
593 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 
154 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  31.47 
 
 
593 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  27.82 
 
 
158 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  32.41 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  35.51 
 
 
300 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>