More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1327 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 511 aa  1047    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  36.94 
 
 		 472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  37.05 
 
 		 488 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  36.51 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  36.01 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  32.28 
 
 		 518 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  34.31 
 
 		 501 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  35.04 
 
 		 485 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  35.37 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  35.73 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  35.04 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  35.27 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  35.57 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  34.77 
 
 		 490 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  34.15 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  35.16 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  37.1 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  35.47 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  35.47 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  35.47 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  34.38 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  33.8 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  33.56 
 
 		 484 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  33.56 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  35.28 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  35.28 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  35.28 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  35.28 
 
 		 514 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  33.87 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  31.98 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  32.67 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  32.51 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  35.51 
 
 		 514 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  31.61 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  33.56 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  33.18 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 523 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  30.84 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  32.49 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  29.54 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  29.82 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  33.02 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  33.02 
 
 		 518 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 518 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  33.02 
 
 		 518 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  32.67 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  33.02 
 
 		 518 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  33.02 
 
 		 518 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  32.35 
 
 		 517 aa  223  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  33.19 
 
 		 508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  29.17 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  30.68 
 
 		 462 aa  219  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  28.96 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  28.87 
 
 		 478 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  32.7 
 
 		 472 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  28.64 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  28.64 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  28.64 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  28.64 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  28.64 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  28.64 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  29.26 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  32.46 
 
 		 458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  30.23 
 
 		 476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  28.18 
 
 		 457 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  29.37 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  29.04 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  28.8 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  28.7 
 
 		 456 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  29.08 
 
 		 718 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  28.06 
 
 		 511 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.37 
 
 		 410 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  26.3 
 
 		 714 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  26.7 
 
 		 553 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  27.08 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  38.69 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  28.85 
 
 		 581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  26.02 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  26.32 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  31.29 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  26.34 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  29.47 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  29.47 
 
 		 402 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  25.75 
 
 		 499 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  30.91 
 
 		 410 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  25.34 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  35.33 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  26.52 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  23.67 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  26.04 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  26.35 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  27.01 
 
 		 502 aa  87  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  27.25 
 
 		 508 aa  87  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>