More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2596 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  100 
 
 		 456 aa  941    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  41.14 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 		 528 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  36.07 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  37.14 
 
 		 498 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  38.17 
 
 		 530 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  38.24 
 
 		 456 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  36.75 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  37.92 
 
 		 534 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  38.28 
 
 		 525 aa  289  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  37.36 
 
 		 518 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  39.09 
 
 		 494 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  36.9 
 
 		 485 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  37.05 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  36.34 
 
 		 486 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  37.97 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  36.39 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  35.95 
 
 		 485 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  36.19 
 
 		 485 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  38.58 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  36.06 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  38.2 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  38.2 
 
 		 477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  34.53 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  38.2 
 
 		 478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  34.92 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  38.26 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  38.26 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  37.96 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  35.12 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  39.59 
 
 		 476 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  39.59 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  38.26 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  39.59 
 
 		 476 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  39.59 
 
 		 476 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  39.65 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  37.71 
 
 		 478 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  35.78 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  36.19 
 
 		 490 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  35.48 
 
 		 472 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  37.37 
 
 		 480 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  38.05 
 
 		 480 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  35.36 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  35.13 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  36.86 
 
 		 502 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  35.05 
 
 		 518 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  35.13 
 
 		 518 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  35.13 
 
 		 518 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  35.13 
 
 		 518 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  36.89 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  36.95 
 
 		 458 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  36.95 
 
 		 472 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  35.75 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  37.2 
 
 		 493 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  34.76 
 
 		 485 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 		 718 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  34.26 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  36.76 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  37.28 
 
 		 494 aa  247  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  33.64 
 
 		 514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  33.64 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  33.64 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  33.64 
 
 		 514 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  36.25 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  37.3 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  36.87 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  37.06 
 
 		 508 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  33.56 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  34.73 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  34.62 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  33.86 
 
 		 517 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  33.41 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  32.13 
 
 		 511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  31.5 
 
 		 714 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  39.79 
 
 		 523 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  33.26 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  28.7 
 
 		 511 aa  189  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  37.8 
 
 		 482 aa  166  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  30.05 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  29.43 
 
 		 476 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 505 aa  156  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.16 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  27.97 
 
 		 475 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  28.01 
 
 		 500 aa  150  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  29 
 
 		 475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  41.4 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  27.85 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  30.08 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  27.98 
 
 		 502 aa  143  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  26.75 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  28.29 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.7 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  30.74 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.43 
 
 		 477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  26.56 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  29.47 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  27.21 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>