More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0695 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 523 aa  1038    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  40.67 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  38.21 
 
 		 502 aa  300  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  37.61 
 
 		 488 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  50.19 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  39.79 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  34.38 
 
 		 485 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  34.27 
 
 		 498 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  47.91 
 
 		 449 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  35.52 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  35.07 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  38.03 
 
 		 437 aa  263  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  36.73 
 
 		 476 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  46.77 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  33.88 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  46.15 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  36.25 
 
 		 493 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  46.39 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  36.33 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  35.06 
 
 		 534 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  33.88 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  34.69 
 
 		 530 aa  253  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  33.47 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  35.52 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  35.52 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  35.52 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  34.62 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  34.62 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  34.62 
 
 		 518 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  47.87 
 
 		 523 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  35.68 
 
 		 518 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  35.68 
 
 		 518 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  35.68 
 
 		 518 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  43.21 
 
 		 501 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  36.11 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  46.99 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  48.91 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  43.93 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  34.78 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  43.93 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  36.22 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  33.2 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  33.01 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  43.84 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  42.96 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  35.02 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  33.33 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  33.33 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  33.33 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  33.33 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  34.8 
 
 		 478 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  34.99 
 
 		 480 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  34.8 
 
 		 478 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  32.85 
 
 		 480 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  32.3 
 
 		 518 aa  236  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  43.84 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  32.92 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  34.58 
 
 		 477 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  41.72 
 
 		 517 aa  233  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  41.91 
 
 		 718 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  48.31 
 
 		 467 aa  233  8.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  34.47 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  33.19 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  33.76 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  31.53 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  33.76 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  33.76 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  33.76 
 
 		 476 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  44.31 
 
 		 482 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  45.26 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  33.7 
 
 		 478 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  39.79 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  29.76 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.13 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.3 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  35.74 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  30.36 
 
 		 402 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  30.08 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  34.63 
 
 		 410 aa  144  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  40.13 
 
 		 714 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  26.62 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  24.65 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  34.73 
 
 		 476 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  29.53 
 
 		 473 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  26.05 
 
 		 489 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 505 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  26.15 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  35.33 
 
 		 475 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  27.69 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  34.94 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>