More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2552 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  100 
 
 		 517 aa  1058    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  39.96 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  37.58 
 
 		 508 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 		 516 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  35.6 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  34.35 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  32.08 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  32.92 
 
 		 497 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 500 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  29.91 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  30.79 
 
 		 461 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  32.56 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  30.86 
 
 		 476 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  32.86 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  31.52 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  30.48 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  28.67 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  27.63 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  29.33 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  29.15 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  28.91 
 
 		 468 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  28.94 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  27.69 
 
 		 714 aa  143  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  27.13 
 
 		 456 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  28.3 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  27.88 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  29.39 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  27.11 
 
 		 494 aa  113  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  27.73 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  29.02 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  26.54 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  26.49 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  28.72 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  26.35 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  25.64 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  28.04 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  27.39 
 
 		 498 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  26.25 
 
 		 485 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  27.86 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  28.2 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  26.39 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  27.89 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  27.33 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  26.58 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  28.2 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  28.2 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  28.2 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  28.47 
 
 		 458 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  26.45 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  28.47 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  26.65 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  26.45 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  25.55 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  26.45 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  28.2 
 
 		 518 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  26.71 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  26.45 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  26.56 
 
 		 480 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  26.58 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  26 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  26 
 
 		 478 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  26.63 
 
 		 480 aa  97.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  27.33 
 
 		 508 aa  97.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  26.95 
 
 		 472 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  25.59 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  27.13 
 
 		 437 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  26.2 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  26.11 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  25.51 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  25.52 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  26.38 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  26.29 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  27.08 
 
 		 490 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  25.6 
 
 		 502 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  26.59 
 
 		 518 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  26.38 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  26.38 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  24.65 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  29.11 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  26.38 
 
 		 513 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  27.05 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  27.05 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  27.05 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  26.82 
 
 		 514 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  26.78 
 
 		 508 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  26.11 
 
 		 488 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  26.39 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  25.39 
 
 		 494 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  25.12 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  25.84 
 
 		 501 aa  86.7  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  27.21 
 
 		 517 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  30.47 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  26.03 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.04 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>