More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004281 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  100 
 
 
525 aa  1073    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  89.52 
 
 
534 aa  981    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  71.95 
 
 
530 aa  707    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  60.99 
 
 
494 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  50.8 
 
 
523 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  46.97 
 
 
486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  47.86 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  47.86 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  46.3 
 
 
485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  50.11 
 
 
518 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  42.83 
 
 
518 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  47.86 
 
 
513 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  49.89 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  49.89 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  49.89 
 
 
518 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  49.89 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  48.98 
 
 
493 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  49.89 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  49.2 
 
 
514 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  49.2 
 
 
514 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  49.2 
 
 
514 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  45.92 
 
 
502 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  48.97 
 
 
514 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  49.55 
 
 
508 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  49.18 
 
 
458 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  49.18 
 
 
472 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  49.43 
 
 
508 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  48.97 
 
 
514 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  47.05 
 
 
480 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  45.7 
 
 
718 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  44.23 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  45.59 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  43.08 
 
 
476 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  45.89 
 
 
479 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  45.11 
 
 
494 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  44.13 
 
 
480 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  42.86 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  43.34 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  42.86 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  43.63 
 
 
477 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  44.59 
 
 
462 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  43.38 
 
 
476 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  43.6 
 
 
476 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  43.6 
 
 
476 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  43.6 
 
 
476 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  45.52 
 
 
437 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  41.79 
 
 
472 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  44.58 
 
 
457 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  43.86 
 
 
494 aa  359  9e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  38.92 
 
 
488 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  37.02 
 
 
501 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  39.62 
 
 
485 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  39.2 
 
 
485 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  39.24 
 
 
485 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  40.13 
 
 
498 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  38.3 
 
 
490 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  38.73 
 
 
486 aa  329  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  39.65 
 
 
449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  41.06 
 
 
457 aa  326  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  39.5 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  40.42 
 
 
456 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  38.8 
 
 
444 aa  310  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  37.73 
 
 
528 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  36.77 
 
 
484 aa  299  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  39.49 
 
 
467 aa  289  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  38.28 
 
 
456 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 
471 aa  281  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  37.95 
 
 
450 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  34.66 
 
 
478 aa  257  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 
470 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  34.74 
 
 
472 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  33.47 
 
 
523 aa  253  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  34.79 
 
 
482 aa  249  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 
511 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  34.53 
 
 
511 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.49 
 
 
553 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 
482 aa  179  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  29.66 
 
 
714 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.5 
 
 
410 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  28.79 
 
 
481 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  36.69 
 
 
581 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  40.23 
 
 
402 aa  127  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  40.23 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  39.08 
 
 
410 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  31.73 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  26.71 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  27.95 
 
 
476 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  26.03 
 
 
502 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  29.2 
 
 
475 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  23.87 
 
 
485 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  25.6 
 
 
516 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  26.17 
 
 
489 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  27.58 
 
 
471 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  28.83 
 
 
475 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
505 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  27.57 
 
 
473 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  26.84 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  25.8 
 
 
473 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>