More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004396 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  100 
 
 		 502 aa  1022    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  79.59 
 
 		 489 aa  816    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  56.55 
 
 		 472 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  46.61 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  46.39 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  38.99 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  37.09 
 
 		 516 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  39.44 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  38.04 
 
 		 500 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  35.84 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 508 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  34.73 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 		 505 aa  291  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  31.32 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  30.02 
 
 		 475 aa  224  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  31.16 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  28.12 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  29.29 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  28.05 
 
 		 473 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  31.25 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  29.22 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  28.51 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  28.73 
 
 		 468 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  28.51 
 
 		 480 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  27.98 
 
 		 456 aa  143  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  26.53 
 
 		 714 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  27.52 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  26.14 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  27.06 
 
 		 486 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  25.81 
 
 		 485 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  26.36 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  24.89 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  25.29 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  27.65 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  28.38 
 
 		 480 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  27.38 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  27.34 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  27.29 
 
 		 502 aa  107  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  26.03 
 
 		 525 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  25.16 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  25.68 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  27.94 
 
 		 518 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  25.98 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  25.11 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  25.1 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.09 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  24.82 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  24.94 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  23.31 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  26.82 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  26.02 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  26.02 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  26.02 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  24.66 
 
 		 486 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  25.61 
 
 		 476 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  26.01 
 
 		 477 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  26.38 
 
 		 523 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  25.86 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  25.26 
 
 		 494 aa  94  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  25.94 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  26.05 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  24.39 
 
 		 513 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  24.39 
 
 		 486 aa  90.1  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  24.39 
 
 		 486 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  23.94 
 
 		 472 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  24.76 
 
 		 528 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  27.14 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  22.43 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  23.35 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  23.59 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  26.15 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  23.56 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  28.22 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  25.28 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  33.09 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  34.67 
 
 		 189 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  25.28 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  25.28 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  25.28 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  25.28 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  25.28 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  25.25 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  27.87 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  25.25 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  24 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  23.49 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  37.06 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.12 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 191 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>