More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3043 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  82.95 
 
 
518 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  82.95 
 
 
518 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  82.95 
 
 
518 aa  826    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  81.45 
 
 
514 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  81.58 
 
 
514 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  82.74 
 
 
518 aa  823    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  81.58 
 
 
514 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  82.95 
 
 
518 aa  827    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  82.95 
 
 
518 aa  826    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  100 
 
 
517 aa  1063    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  82.3 
 
 
472 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  81.58 
 
 
514 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  81.65 
 
 
514 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  82.53 
 
 
458 aa  754    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  61.25 
 
 
485 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  61.46 
 
 
486 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  64.21 
 
 
508 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  63.58 
 
 
508 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  62.45 
 
 
493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  59.88 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  59.88 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  59.67 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  49.77 
 
 
530 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  44.23 
 
 
525 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  46.22 
 
 
534 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  44.91 
 
 
494 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  48.04 
 
 
462 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  47.51 
 
 
523 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  42.15 
 
 
518 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  43.61 
 
 
718 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  43.64 
 
 
476 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  44.79 
 
 
494 aa  360  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  44.36 
 
 
502 aa  359  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  44.99 
 
 
479 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  41.63 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  43.52 
 
 
477 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  42.47 
 
 
494 aa  349  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  41.63 
 
 
457 aa  348  9e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  43.52 
 
 
478 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  43.28 
 
 
478 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  43.28 
 
 
478 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  40.89 
 
 
472 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  41.53 
 
 
480 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  43.28 
 
 
476 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  43.28 
 
 
476 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  43.28 
 
 
476 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  43.28 
 
 
476 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  42.37 
 
 
476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  40.32 
 
 
437 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  44.39 
 
 
467 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  40.94 
 
 
457 aa  323  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  36.14 
 
 
501 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  42.13 
 
 
528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  39.63 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  39.64 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  40.78 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  39.64 
 
 
485 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  39.1 
 
 
488 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  40.29 
 
 
449 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  38.02 
 
 
498 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  38.15 
 
 
502 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  39.9 
 
 
456 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  39.32 
 
 
451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  37.04 
 
 
490 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  37.97 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  36.75 
 
 
478 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  38.67 
 
 
444 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  39.27 
 
 
450 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 
471 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 
470 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  36.39 
 
 
482 aa  256  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  33.56 
 
 
484 aa  246  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  33.86 
 
 
456 aa  246  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  33.47 
 
 
523 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 
511 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  33.42 
 
 
511 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  29.12 
 
 
714 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.96 
 
 
553 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 
482 aa  160  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.57 
 
 
410 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  45.4 
 
 
410 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  50.61 
 
 
402 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  50 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  36.57 
 
 
581 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  27.42 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  26.28 
 
 
475 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  25.7 
 
 
473 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  24.94 
 
 
476 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  25.56 
 
 
471 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  24.3 
 
 
473 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.06 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  24.55 
 
 
473 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  25.12 
 
 
497 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  23.93 
 
 
475 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  25.21 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  24.89 
 
 
485 aa  84  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  22.77 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>