More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3239 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  100 
 
 		 714 aa  1475    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  32.68 
 
 		 457 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  31.5 
 
 		 456 aa  210  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  30.59 
 
 		 486 aa  204  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  31.16 
 
 		 498 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  31.8 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  29.36 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  30.37 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 476 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  31.29 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  30.75 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  31.33 
 
 		 456 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  32.13 
 
 		 478 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  31.32 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  29.74 
 
 		 485 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  30.1 
 
 		 488 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  31.83 
 
 		 476 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  31.88 
 
 		 478 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  31.64 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  30.48 
 
 		 497 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  31.64 
 
 		 478 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  31.99 
 
 		 480 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  30.53 
 
 		 513 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  32.13 
 
 		 479 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  30.53 
 
 		 486 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  30.53 
 
 		 486 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  30.54 
 
 		 472 aa  180  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  31.08 
 
 		 457 aa  180  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  31.04 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 516 aa  180  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  29.44 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  30.72 
 
 		 534 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  28.33 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  30.17 
 
 		 494 aa  178  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  30.18 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  31.5 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  30.79 
 
 		 471 aa  177  8e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  30.43 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  31.66 
 
 		 718 aa  176  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  30.92 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  30.84 
 
 		 444 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  29.44 
 
 		 502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  29.27 
 
 		 494 aa  174  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  29.82 
 
 		 494 aa  174  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  29.66 
 
 		 525 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  30.38 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  30.24 
 
 		 493 aa  171  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  29.09 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  29.09 
 
 		 514 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  29.09 
 
 		 514 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  29.09 
 
 		 514 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  29.02 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  29.78 
 
 		 490 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  30.69 
 
 		 467 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  30.63 
 
 		 508 aa  164  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  28.37 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  28.21 
 
 		 484 aa  161  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  28.37 
 
 		 518 aa  160  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  28.12 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  30.28 
 
 		 508 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 500 aa  159  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  28.12 
 
 		 518 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  28.12 
 
 		 518 aa  158  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  28.12 
 
 		 518 aa  158  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  28.12 
 
 		 518 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  26.48 
 
 		 482 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  29.71 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  28.85 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 523 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  27.67 
 
 		 458 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 505 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  27.67 
 
 		 472 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  29.12 
 
 		 517 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.84 
 
 		 477 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  26.73 
 
 		 501 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  26.94 
 
 		 472 aa  151  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  27.29 
 
 		 461 aa  150  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  27.35 
 
 		 489 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  29.96 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  26.73 
 
 		 505 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  26.53 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  26.3 
 
 		 511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  28.07 
 
 		 433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  27.03 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 517 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  27.25 
 
 		 482 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  25.22 
 
 		 508 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  25.88 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  26.17 
 
 		 511 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  27.62 
 
 		 481 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 470 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  23.97 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  23.19 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  24.18 
 
 		 468 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  24.37 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>