More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4190 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  92.99 
 
 		 485 aa  927    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  92.65 
 
 		 449 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  83.91 
 
 		 456 aa  769    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  73.8 
 
 		 490 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  84.03 
 
 		 498 aa  838    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  82.51 
 
 		 486 aa  844    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  100 
 
 		 485 aa  1003    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  73.36 
 
 		 488 aa  748    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  73.67 
 
 		 444 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  92.78 
 
 		 485 aa  945    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  75.17 
 
 		 451 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  45.81 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  47.2 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  42.21 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  43.6 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  46.05 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  43.27 
 
 		 518 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  45.48 
 
 		 523 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  40.93 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  43.37 
 
 		 485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  41.2 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  44.34 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  44.34 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  44.34 
 
 		 513 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  39.62 
 
 		 525 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  40.93 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  40.45 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  45.3 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  40 
 
 		 502 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  43.37 
 
 		 486 aa  332  9e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  39.87 
 
 		 478 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  37.97 
 
 		 476 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  41.57 
 
 		 530 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  40.56 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  39.49 
 
 		 534 aa  330  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  42.42 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  39.64 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  41.26 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  39.82 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  40.13 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  40.13 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  40.13 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  39.42 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  40.13 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  39.41 
 
 		 457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  43.69 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  40.75 
 
 		 471 aa  325  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  39.63 
 
 		 478 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  39.56 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  39 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  43.47 
 
 		 508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  40.95 
 
 		 718 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  41.3 
 
 		 462 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  39.41 
 
 		 518 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  39.19 
 
 		 518 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  39.19 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  39.19 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  39.19 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  40.29 
 
 		 514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  40.29 
 
 		 514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  40.05 
 
 		 514 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  40.29 
 
 		 514 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  39.17 
 
 		 458 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  39.17 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  38.58 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  40.33 
 
 		 511 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  40.29 
 
 		 514 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  39.64 
 
 		 517 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  36.9 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 		 450 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  37.05 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  38.59 
 
 		 467 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  35.27 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  46.39 
 
 		 523 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 464 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  29.74 
 
 		 714 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.61 
 
 		 553 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.5 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 505 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  28.9 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  33.69 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  33.69 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  32.01 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  28.3 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.57 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  27.85 
 
 		 485 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  26.25 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  26.36 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  27.64 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  25.99 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  25.44 
 
 		 489 aa  114  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  25.51 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  26.71 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  25.84 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  26.96 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  25.49 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>