More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3114 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 523 aa  1068    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  53.86 
 
 		 518 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  57.38 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  50.68 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  50.8 
 
 		 525 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  52.29 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  51.99 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  49.46 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  49.54 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  48.51 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  50.12 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  51.2 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  51.2 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  51.2 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  49.77 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  49.88 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  48.48 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  48.2 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  48.82 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  47.67 
 
 		 480 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  48.82 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  48.82 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  48.82 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  50 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  48.91 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  50.71 
 
 		 486 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  48.91 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  48.66 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  48.18 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  51.21 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  49.76 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  51.46 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  46.83 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  46.83 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  46.83 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  46.83 
 
 		 518 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  46.83 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  47.32 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  47.32 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 718 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  47.78 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  47.14 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  47.14 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  47.14 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  46.9 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  46.25 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  47.14 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  47.51 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  45.09 
 
 		 494 aa  363  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  43.18 
 
 		 488 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  45.05 
 
 		 449 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  44.52 
 
 		 486 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  42.7 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  45.48 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  43.64 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  44.76 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  44.76 
 
 		 485 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  43.08 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  43.28 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  45.87 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  42.46 
 
 		 528 aa  345  8.999999999999999e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  41.77 
 
 		 444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  44.72 
 
 		 467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  42.28 
 
 		 484 aa  325  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  42.41 
 
 		 502 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  41.2 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  39.04 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  40.24 
 
 		 478 aa  292  9e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  39.23 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  39.65 
 
 		 456 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  40.1 
 
 		 450 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  47.87 
 
 		 523 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.53 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  29.2 
 
 		 714 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.05 
 
 		 553 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  28.41 
 
 		 497 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  42.29 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  40.51 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  42.53 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 		 485 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  41.95 
 
 		 402 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  26.54 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  27.15 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  26.29 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  27.48 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  24.77 
 
 		 476 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  27.33 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  29.5 
 
 		 477 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  25.31 
 
 		 471 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  27.38 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  25.88 
 
 		 505 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>