More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1272 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 402 aa  834    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  97.51 
 
 		 402 aa  815    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  61.17 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  32.37 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  28.95 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  32.26 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 		 523 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  37.39 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  32.46 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  33.22 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  33.69 
 
 		 488 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  41.95 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  34.49 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  43.71 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  32.97 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  33.69 
 
 		 485 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  32.97 
 
 		 485 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  32.62 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 502 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  29.33 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  44.58 
 
 		 718 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  40.57 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  44.05 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  40.8 
 
 		 480 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  41.38 
 
 		 476 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  39.55 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  50 
 
 		 517 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  38.76 
 
 		 498 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  39.56 
 
 		 467 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  40.57 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  44.58 
 
 		 476 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  29.33 
 
 		 485 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  47.56 
 
 		 518 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  31.9 
 
 		 456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  48.17 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  48.17 
 
 		 458 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  48.17 
 
 		 518 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  48.17 
 
 		 518 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  48.17 
 
 		 518 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  48.17 
 
 		 518 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  40.8 
 
 		 530 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  48.17 
 
 		 518 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  40.8 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  39.69 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  40.23 
 
 		 534 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  41.95 
 
 		 523 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  40.23 
 
 		 525 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  45.4 
 
 		 514 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  45.4 
 
 		 514 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  45.4 
 
 		 514 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  45.4 
 
 		 514 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  45.4 
 
 		 514 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  41.86 
 
 		 493 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.24 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  40.11 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  40 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  40 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  40 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  39.66 
 
 		 457 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  40.96 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  33.73 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  40.96 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  42.53 
 
 		 494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  39.08 
 
 		 477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  38.83 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  40.36 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  38.12 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  29.25 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  37.65 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  38.32 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  37.57 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.23 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  36.65 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  33.93 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  29.47 
 
 		 511 aa  99.4  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  35.48 
 
 		 714 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 		 481 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  34.27 
 
 		 581 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  27.08 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  28.31 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  27.85 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  46.88 
 
 		 244 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  39.52 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  29.13 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  30.18 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  37.82 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>