More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2770 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  84.5 
 
 
518 aa  881    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  83.83 
 
 
472 aa  810    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  99.61 
 
 
514 aa  1049    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  84.5 
 
 
518 aa  881    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  100 
 
 
514 aa  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  81.58 
 
 
517 aa  814    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  84.5 
 
 
518 aa  881    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  99.81 
 
 
514 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  84.72 
 
 
458 aa  799    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  84.5 
 
 
518 aa  882    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  84.3 
 
 
518 aa  878    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  99.81 
 
 
514 aa  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  84.5 
 
 
518 aa  881    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  100 
 
 
514 aa  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  62.71 
 
 
485 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  61.67 
 
 
486 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  60.08 
 
 
486 aa  587  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  59.88 
 
 
513 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  60.08 
 
 
486 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  61.57 
 
 
508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  61.57 
 
 
508 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  62.03 
 
 
493 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  50.23 
 
 
530 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  47.37 
 
 
525 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  47.29 
 
 
534 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  45.66 
 
 
494 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  48.15 
 
 
462 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  44.04 
 
 
518 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  47.14 
 
 
523 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 
718 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  45.37 
 
 
502 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  44.21 
 
 
494 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  41.67 
 
 
476 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  43.72 
 
 
479 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  43.07 
 
 
480 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  40.84 
 
 
480 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  42.63 
 
 
478 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  42.86 
 
 
478 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  43.65 
 
 
477 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  42.63 
 
 
478 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  41.5 
 
 
457 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  42.31 
 
 
476 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  41.45 
 
 
472 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  42.31 
 
 
476 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  42.31 
 
 
476 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  42.31 
 
 
476 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  40.88 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  40.95 
 
 
437 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  40.9 
 
 
494 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  40.32 
 
 
486 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  39.2 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  42.42 
 
 
467 aa  310  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  41.65 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  38.44 
 
 
485 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  38.67 
 
 
485 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  40.05 
 
 
485 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  38.39 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  39.95 
 
 
449 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  36.84 
 
 
501 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  38.25 
 
 
498 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  39.8 
 
 
456 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 
502 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  39.56 
 
 
451 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  38.2 
 
 
490 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  40.1 
 
 
472 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  38.08 
 
 
444 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  38.57 
 
 
478 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  39.76 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 
470 aa  262  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 
482 aa  260  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  34.71 
 
 
484 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 
471 aa  254  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  33.64 
 
 
456 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  35.28 
 
 
511 aa  246  6.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
523 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  29.09 
 
 
714 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.44 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
464 aa  146  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.27 
 
 
410 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  45.98 
 
 
410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  29.22 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  45.4 
 
 
402 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  45.4 
 
 
402 aa  126  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  35.41 
 
 
581 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  26.21 
 
 
473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  26.58 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  26.01 
 
 
476 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  24.87 
 
 
473 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  24.5 
 
 
475 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  25.62 
 
 
471 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  25.6 
 
 
473 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  27.96 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  28.41 
 
 
477 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  25.56 
 
 
468 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
505 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  25.8 
 
 
468 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  25.74 
 
 
480 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  25.58 
 
 
497 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>