More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0288 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 		 410 aa  825    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  35.44 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  33.33 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  37.17 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  33.89 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 		 502 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  32.66 
 
 		 490 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  34.13 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  32.42 
 
 		 518 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  31.05 
 
 		 485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  32.55 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  30.84 
 
 		 501 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  31.18 
 
 		 485 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  31.02 
 
 		 476 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  30.77 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  30.77 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  41.2 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  31.53 
 
 		 523 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  30.77 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  30.25 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  31.34 
 
 		 498 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  41.25 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  32.5 
 
 		 494 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  31.75 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  31.85 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  40.87 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  30.27 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  30.02 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  31.18 
 
 		 449 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  39.66 
 
 		 486 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  42.13 
 
 		 523 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  30.02 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  30.67 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  30.68 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  29.7 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  30.68 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  30.68 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  29.78 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  46.67 
 
 		 470 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  39.5 
 
 		 485 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  40.61 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  42.67 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  29.82 
 
 		 480 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  39.74 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  39.82 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  31.51 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  43.11 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  38.94 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  47.34 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  37.16 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  38.5 
 
 		 525 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  37.16 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  37.16 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  37.16 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  37.16 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  37.16 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  28.14 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  37.16 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  37.16 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  36.84 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  36.73 
 
 		 530 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  35.94 
 
 		 493 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  44.89 
 
 		 482 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  35.66 
 
 		 517 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 718 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  35.27 
 
 		 514 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  35.27 
 
 		 514 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  35.27 
 
 		 514 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  35.27 
 
 		 514 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  35.27 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  41.62 
 
 		 481 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  27.7 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  37.77 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  34.39 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  36.48 
 
 		 485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  34.39 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.5 
 
 		 553 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  42.94 
 
 		 482 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  35.24 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  34.8 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1940  Lytic transglycosylase catalytic  46.79 
 
 		 581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  23.18 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  25.6 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  32.91 
 
 		 714 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  27.48 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  26.67 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  27.72 
 
 		 475 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  36.67 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  27.31 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  33.09 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  26.36 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  29.73 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  23.09 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  34.91 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.08 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  26.55 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>