More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2289 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  100 
 
 		 475 aa  951    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  94.96 
 
 		 476 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  64.84 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  64.25 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  61.02 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  57.56 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  57.63 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  60.36 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  58.44 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  58.23 
 
 		 480 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  57.94 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  32.87 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  30.7 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  30.8 
 
 		 502 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  30.39 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 		 505 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  30.8 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  30.02 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  30.93 
 
 		 499 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  26.81 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  26.48 
 
 		 472 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  29.04 
 
 		 433 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  29.4 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  29 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  28.43 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  27.25 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  30.37 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  25 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  26.67 
 
 		 488 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  28.67 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  23.7 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  26.03 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  26.17 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  24.5 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  24.5 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  24.5 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  26.67 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  24.28 
 
 		 514 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  27.25 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  24.81 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  24.81 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  24.81 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  24.81 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  24.81 
 
 		 518 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  25 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  27.53 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  26.21 
 
 		 485 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  25.76 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  24.77 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  24.73 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  24.6 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  24.73 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  24.64 
 
 		 485 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  25.81 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  26.2 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  25.49 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  24.22 
 
 		 714 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  25.89 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  25.89 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  25.24 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  25.49 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  24.2 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  29.16 
 
 		 467 aa  100  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  25.65 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  24.28 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  26.9 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  27.09 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  24.29 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  25 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  23.13 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  35.33 
 
 		 523 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  25.98 
 
 		 498 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  25.81 
 
 		 502 aa  93.2  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.72 
 
 		 410 aa  93.2  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  25.82 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  24.61 
 
 		 494 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  26.27 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  24.64 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  25.11 
 
 		 477 aa  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  25.97 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  25.48 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  24.76 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  26.43 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  24.89 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  23.93 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  25.72 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>