More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2061 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  91.75 
 
 		 473 aa  894    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  100 
 
 		 473 aa  966    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  61.54 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  63.62 
 
 		 471 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  58.84 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  59.91 
 
 		 475 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  57.76 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  57.76 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  60.72 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  57.46 
 
 		 476 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  57.68 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  31.84 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  30.45 
 
 		 497 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  29.5 
 
 		 485 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  32.79 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  28.26 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  26.75 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 		 516 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  28.31 
 
 		 489 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  30.05 
 
 		 505 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  27.17 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  27.71 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  29.45 
 
 		 499 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  28.63 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  26.09 
 
 		 479 aa  123  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  26.54 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  25.95 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  25.95 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  25.95 
 
 		 514 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  25.7 
 
 		 514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  25.19 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  24.94 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  25.86 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  26.54 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  24.87 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  24.87 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  26.57 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  25.31 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  25.31 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  24.5 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  25.31 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  24.26 
 
 		 480 aa  106  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  25.31 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  25.06 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2810  putative transglycosylase  25.95 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.28375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  24.82 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  25.46 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  24.93 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  23.59 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  24.8 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  25 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  24.54 
 
 		 485 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  25.12 
 
 		 476 aa  100  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  24.88 
 
 		 485 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  25.28 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  24.31 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3043  putative transglycosylase  25.7 
 
 		 517 aa  97.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.775137  normal  0.0587061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  23.88 
 
 		 488 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  24.36 
 
 		 449 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  24.64 
 
 		 714 aa  97.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  23.73 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  25.8 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  26.01 
 
 		 490 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  24.66 
 
 		 530 aa  94  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  25.58 
 
 		 534 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  22.81 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  24.19 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  22.94 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  25.98 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  24.12 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  24.15 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  22.98 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  22.3 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  25.08 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  24.14 
 
 		 498 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  22.25 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  24.27 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  23.08 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  23.95 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  23.37 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  30.83 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  23.98 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  23.98 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  23.98 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  26.34 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  23.91 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  25 
 
 		 494 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  25.07 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  21.31 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>