More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2659 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 508 aa  1042    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  72.79 
 
 		 499 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  69.78 
 
 		 505 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  45.09 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 481 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  38 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  37.19 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  37.85 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  36.24 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  34.43 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  33.69 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  34.33 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  36.33 
 
 		 517 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  34.66 
 
 		 500 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 		 505 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  34.03 
 
 		 476 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  33.8 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  33.17 
 
 		 475 aa  223  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  32.79 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  31.38 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  31.41 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  29.27 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  29.04 
 
 		 480 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  28.54 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  25.22 
 
 		 714 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  28.3 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  27.58 
 
 		 488 aa  114  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  28.47 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  27.42 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  24.61 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  27.85 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  27.19 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  26.05 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  27.3 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  26.21 
 
 		 485 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  27.29 
 
 		 490 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  25.74 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  26.63 
 
 		 479 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  26.36 
 
 		 523 aa  97.4  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  26 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  25.75 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  27.36 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  26.27 
 
 		 456 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  25.68 
 
 		 494 aa  93.6  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  26.38 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  26.38 
 
 		 485 aa  91.3  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  24.36 
 
 		 534 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  24.44 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  25 
 
 		 484 aa  87  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  23.66 
 
 		 525 aa  87.4  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  27.25 
 
 		 511 aa  86.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  32.34 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  26.39 
 
 		 501 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  27.32 
 
 		 467 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  24.19 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  25.49 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  23.09 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  24.62 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  25.75 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  34.3 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  26.2 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  26.2 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  26.2 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  25.61 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  33.54 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 		 729 aa  80.1  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  24.68 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  31.77 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 731 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  23.33 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  34.18 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  24.36 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.74 
 
 		 651 aa  78.2  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  31.77 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  24.13 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  24.1 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  24.1 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  24.1 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  32.5 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  24.1 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  25.61 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  23.4 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  25.62 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  33.97 
 
 		 724 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  24.89 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.71 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  33.97 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  23.49 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  32.94 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  24.66 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  28.16 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  26.55 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  23.52 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  33.1 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  28.99 
 
 		 642 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>