More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1506 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 485 aa  991    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  58.93 
 
 		 497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 		 500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 516 aa  362  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  39.46 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  39.28 
 
 		 489 aa  342  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  39.44 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  39.57 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  38.5 
 
 		 461 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  37.85 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 		 505 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  37.73 
 
 		 499 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  31.95 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  31.9 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  30.09 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  31.42 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  29.82 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  31.54 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  29.14 
 
 		 480 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  34.39 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  29.2 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  28.95 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  29.09 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  29.36 
 
 		 714 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  31.54 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  28.7 
 
 		 518 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  29.84 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  28.44 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  26.45 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  28.47 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  28.12 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  27.92 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  29.41 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  27.85 
 
 		 485 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  28.07 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  26.09 
 
 		 472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  27.84 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  27.67 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  27.64 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  27.4 
 
 		 449 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  26.1 
 
 		 476 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  28.09 
 
 		 478 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  25.36 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  26.52 
 
 		 494 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  28.09 
 
 		 478 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  28.09 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  26.77 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  27.98 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  26.21 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  27.49 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  26.73 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  26.26 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  26.71 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  26.47 
 
 		 528 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  28.44 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  28.46 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  28.46 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  28.46 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  28.46 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  25.81 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  26.34 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  28.09 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  25.75 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  26.84 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  26.06 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  26.65 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  25.69 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  23.55 
 
 		 525 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  24.09 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  26.04 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  26.6 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.72 
 
 		 553 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  23.5 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  23.13 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  25.94 
 
 		 718 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0182  lytic transglycosylase, catalytic  27.54 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  26.39 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  24.87 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  23.66 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  25.4 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  23.63 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  23.96 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2844  putative transglycosylase  24.4 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  23.96 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  26.51 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  26.73 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  23.96 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  23.96 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  26.51 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  26.51 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  23.96 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  23.96 
 
 		 518 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.31 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02414  hypothetical protein  24.16 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1272  soluble lytic transglycosylase  28.31 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>