215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1752 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  93.73 
 
 		 287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  93.03 
 
 		 287 aa  557  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  69.11 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  65.52 
 
 		 288 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  57.14 
 
 		 289 aa  346  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  62.07 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  61.69 
 
 		 281 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52.84 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  53.46 
 
 		 279 aa  292  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  51.27 
 
 		 301 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  52 
 
 		 301 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  52.47 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52.24 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  51.84 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  56.49 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  55.23 
 
 		 291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  50.18 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  55.23 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  54.89 
 
 		 297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  55.23 
 
 		 291 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  55.74 
 
 		 298 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  47.22 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  50.19 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  50.83 
 
 		 288 aa  261  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  48.8 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  51.87 
 
 		 276 aa  248  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  44.28 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.91 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  44.62 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  45.74 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  46.81 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  41.26 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  42.8 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  42.44 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  42.44 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  40 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  45.11 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  43.1 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  44.63 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.8 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.08 
 
 		 302 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  33.64 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  32.07 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  33.21 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  33.21 
 
 		 339 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.21 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  32.85 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  32.8 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  32 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  31.3 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  29.39 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.03 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  34.19 
 
 		 341 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.83 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  35.25 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  34.12 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  29.92 
 
 		 359 aa  122  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  31.02 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  29.1 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  31.87 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  32.19 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  34.43 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  32.21 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  29.84 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  29.88 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  31 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.68 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  30.19 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  32.23 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.84 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.44 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  30.31 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  33.63 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.63 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29.03 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  32.41 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  28.81 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  29.79 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  29.79 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  30.27 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  29.48 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.82 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  27.78 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  30.99 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1573  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.94 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000680472  hitchhiker  0.00723568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  30.49 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>