208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2068 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  56.86 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  55.86 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.63 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  54.37 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  56.1 
 
 		 264 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  57.85 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  43.91 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  49.41 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  49.41 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  51.87 
 
 		 287 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  46.34 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  44.49 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  46.06 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  45.35 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.91 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  42.6 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  42.96 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.45 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  45.27 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  46.03 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  43.17 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  46.03 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.11 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  47.11 
 
 		 291 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  49.79 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.71 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  44.66 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  45.78 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.71 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.98 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  43.58 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  37.08 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  39.47 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.49 
 
 		 281 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.08 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.74 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  40.57 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.21 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  30.8 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  32.48 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.51 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  32.07 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  33.8 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  33.33 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  32.77 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  32.35 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  35.55 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  28.63 
 
 		 254 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.99 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  31.84 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.86 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  30.64 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.1 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29.1 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  30.92 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.25 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  33.05 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  33.94 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  33.76 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  34.53 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  34.17 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  33.75 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  32.37 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.17 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  29.63 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  32.47 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  34.43 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  32.92 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  30.42 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  28.05 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.75 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  33.19 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.28 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  34.45 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  34.45 
 
 		 341 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.42 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.87 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.87 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.87 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.64 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  30.64 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.64 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  30.25 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  31.03 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  32.33 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  30.21 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>