204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0430 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  44.25 
 
 		 281 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  40.08 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  40.08 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.91 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  39.37 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  38.06 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.67 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.97 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  37.87 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  39.25 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  37.7 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  36.36 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  38.1 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  37.4 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  37.19 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  35.04 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  33.6 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  36.4 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  36.48 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  37.7 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.48 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  33.47 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  35.8 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  34.96 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  34.96 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  35.89 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.96 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  38.1 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  34.15 
 
 		 339 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  35.48 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  36.64 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.48 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  35.48 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.98 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  34.55 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  38.14 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  35.92 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  35.92 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  33.19 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  37.4 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  35.51 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  35.92 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  35.92 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  35.1 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  35.1 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  37.62 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  38.56 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  35.51 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  35.51 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  35.51 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  35.51 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  37.62 
 
 		 338 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  34.55 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  37.93 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  31.73 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  35 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  33.48 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  34.03 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  32.46 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.07 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  36.03 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  36.07 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  30.67 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.46 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  37.07 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  36.44 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  38.76 
 
 		 330 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  31.8 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  30.54 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  37.12 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  34.41 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  30.38 
 
 		 268 aa  138  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1573  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.95 
 
 		 393 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000680472  hitchhiker  0.00723568 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.48 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  32.3 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.07 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  37.18 
 
 		 341 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  37.18 
 
 		 341 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  32.22 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.67 
 
 		 306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  34.55 
 
 		 359 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  31.69 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.95 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  31.69 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  34.55 
 
 		 359 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  33.49 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>