215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0941 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  51.41 
 
 		 291 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  54.37 
 
 		 276 aa  282  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.63 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  51.39 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  53.72 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.85 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  54.09 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  49.36 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  46.39 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  48.5 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  44.53 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  43.25 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  45.24 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  43.25 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  44.96 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  44.96 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  45.74 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  48.76 
 
 		 302 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.03 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  46.03 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  42.35 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.23 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  46.37 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.93 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  44.53 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  43.82 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  45.31 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  50.97 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  45.34 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  41.31 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  47.21 
 
 		 288 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.96 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  43.41 
 
 		 278 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.59 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.9 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  39.64 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  38.96 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.55 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  33.33 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  34.47 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  35.63 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  33.72 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  31.47 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.2 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  31.7 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  33.58 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  32.11 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  34.06 
 
 		 254 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.05 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  32.92 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  36.28 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  34.93 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  32.22 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.22 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  31.7 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  34.59 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  34.59 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  31.75 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  33.97 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  33.97 
 
 		 339 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  32 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.97 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  33.59 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  31.97 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  31.97 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1573  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.66 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000680472  hitchhiker  0.00723568 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.97 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  36.24 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.4 
 
 		 330 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  30.86 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  31.47 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.79 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.47 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  33.05 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  32.91 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  32.91 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  31.1 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  32.75 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  31.75 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  32.13 
 
 		 338 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  31.64 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  27.24 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  28.51 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  29.15 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.84 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  29.84 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.84 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.02 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  30.17 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  30.43 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  29.84 
 
 		 274 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>