215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7434 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  94.65 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  75.76 
 
 		 291 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  75.42 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  75.42 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  77.45 
 
 		 293 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  58.09 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  56.21 
 
 		 301 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  57.04 
 
 		 391 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  56.79 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  56.55 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  61.79 
 
 		 297 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  63.45 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  58.3 
 
 		 288 aa  322  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  57.84 
 
 		 298 aa  321  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  61.6 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  53.55 
 
 		 287 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  53.55 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  53.61 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  52.84 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  56.07 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  49.45 
 
 		 289 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.86 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.5 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  49.79 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  45.13 
 
 		 279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.54 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  45.29 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  45.29 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  44.44 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  42.45 
 
 		 276 aa  235  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  44.2 
 
 		 278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  41.9 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  39.73 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  40.93 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  44.96 
 
 		 261 aa  222  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  49.77 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  47 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  44.21 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.37 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  42.08 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  33.2 
 
 		 250 aa  155  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  34.16 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.62 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  34.33 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.5 
 
 		 330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  30.74 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.74 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  30.04 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  29.44 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  29.17 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  29.84 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  29.03 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.88 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  29.88 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.78 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  27.84 
 
 		 254 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.84 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  32.41 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  28.28 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.9 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  29.03 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  31.02 
 
 		 341 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  27.59 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  31.02 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  30 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  29.84 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  29.3 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  26.42 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  28.78 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  29.72 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 265 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  29.72 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.35 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.59 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  28.37 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  29.25 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  27.54 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  30.8 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.96 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.86 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  27.53 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  30.57 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  25.2 
 
 		 359 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.38 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  29.43 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.57 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  27.92 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  30.38 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>