206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2117 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  99.64 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  93.88 
 
 		 278 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  75.27 
 
 		 280 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  67.62 
 
 		 283 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  70.22 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  71.49 
 
 		 302 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  50.4 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  44.24 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  44.93 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.21 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  44.32 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.21 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  44.12 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  44.27 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.29 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  46.01 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  44.29 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  46.03 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  45.31 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  46.09 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.09 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  45.68 
 
 		 291 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  46.8 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  43.54 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  43.54 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  43.4 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  55.21 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  44.21 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  42.44 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  38.81 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  43.93 
 
 		 391 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  43.41 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  46.28 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  46.67 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.99 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.72 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.47 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.27 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.54 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  42.59 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.89 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  32.69 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  30.45 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  32.53 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  31.1 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.35 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  29.67 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  31.56 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  31.18 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.92 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.81 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  30.55 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  32.95 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  32.95 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.51 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  29.78 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  26.12 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  30.04 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  29.78 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  30.92 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  27.16 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  27.16 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.82 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.03 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  27.82 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  27.2 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  30.26 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  29.58 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.74 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.03 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.83 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  27.74 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  27.52 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  30.65 
 
 		 338 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  29.11 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  26.81 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  29.11 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.89 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  26.89 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  26.89 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.89 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  27.63 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  26.61 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  28.34 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  28.17 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  26.27 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  27.43 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  27.43 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  27.43 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  26.81 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  26.81 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  27 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  30.04 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  27 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  27 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>