214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0545 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  75.42 
 
 		 268 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  69.69 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  55.6 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  53.41 
 
 		 292 aa  272  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  53.25 
 
 		 306 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  57.01 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  52.04 
 
 		 302 aa  228  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  44.88 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  46.99 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  45.1 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  46.28 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.24 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.88 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  43.58 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  43.87 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  50.23 
 
 		 293 aa  215  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  44.71 
 
 		 301 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.19 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  46.22 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  50 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  46.22 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  50 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.3 
 
 		 315 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  43.82 
 
 		 298 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  50.51 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  49.07 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  43.15 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  43.15 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  44.92 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  43.95 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  43.61 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  47.66 
 
 		 391 aa  208  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  50.79 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.64 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  45.33 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  38.43 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  44.13 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.46 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.46 
 
 		 281 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  43.06 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.94 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.93 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  34.76 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  33.05 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  32.65 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  28.52 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  31.62 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  28.79 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  29.1 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.49 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  28.57 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.3 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  33.65 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.04 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  29.1 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  31.92 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  29.34 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  30.04 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  31.22 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.51 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.04 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  30.4 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  29.91 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  31.12 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  28.38 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  28.26 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.75 
 
 		 330 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.36 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  28.98 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  31.28 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.32 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  29.32 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  27.98 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  31.97 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  29.66 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  27.83 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.05 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.41 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  28.99 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  27.97 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  31.7 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.9 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  27.59 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  29.86 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.81 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  27.9 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.81 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.9 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  26.14 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  28.15 
 
 		 339 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  29.86 
 
 		 338 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  27.47 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  28.91 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  28.91 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>