215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0755 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  100 
 
 		 315 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.88 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  43.58 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.32 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.71 
 
 		 276 aa  222  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  45.02 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  42.44 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  43.38 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.73 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  42.2 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  43.75 
 
 		 264 aa  212  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  44.55 
 
 		 268 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  41.48 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  40.81 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  40.81 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  40.66 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  42.68 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  44.84 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  44.84 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.84 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  44.39 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  40.7 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  42.68 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  38.95 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.39 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  43.44 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  41.57 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  45.67 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  39.22 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  39.02 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.18 
 
 		 281 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  40.24 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.59 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.82 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  43.56 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 288 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  45.77 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  45.27 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  45.27 
 
 		 278 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  34.87 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  37.87 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  31.13 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.28 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  32.65 
 
 		 251 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  32.81 
 
 		 261 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  30.27 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  32.93 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.94 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  28.96 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.29 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  33.64 
 
 		 257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  30.34 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  29.59 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  31.6 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.78 
 
 		 258 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.49 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.78 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  27.94 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  29.23 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  31.45 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  27.4 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  33.65 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.1 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  33.33 
 
 		 281 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  29.01 
 
 		 280 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  27.34 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  31.49 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 254 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  29.86 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.49 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  31.06 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  29.86 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  29.86 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  29.86 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  31.06 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  29.58 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  29.58 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  29.86 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  29.86 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  30.05 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.05 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  29.65 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  30.58 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  29.86 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  29.86 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  29.69 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.86 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  26.36 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.86 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  30.91 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  32.23 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  30.05 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  26.95 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>