238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3162 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 319 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  48.85 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  52.54 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.71 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.93 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  47.27 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.49 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  44.49 
 
 		 264 aa  215  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40.37 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  46.82 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  46.36 
 
 		 291 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.36 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  44.35 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  42.68 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  40.93 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.5 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  42.08 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  41.25 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  39.6 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  43.93 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  41.15 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  39.6 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  41.46 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  41.18 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.17 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  42.08 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.82 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  38.8 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  40.94 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  36.54 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  38.96 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  37.05 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  40.31 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.65 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  40.93 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  40.54 
 
 		 278 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  44.04 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  33.74 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.51 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  27.78 
 
 		 254 aa  119  7.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  32.1 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  28.57 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  29.34 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  29.88 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  30 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  31.25 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.47 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  30.83 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.77 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  30.47 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.96 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  31.88 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  30.08 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  29.92 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  31.88 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  30.67 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.08 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.19 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  30.25 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  30.33 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  32.76 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  29.11 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 268 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  29.46 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  34.12 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.88 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  28.1 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  30.62 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  30.62 
 
 		 255 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  28.68 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  31.17 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.57 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.63 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  28.63 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.63 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1480  competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124446  normal  0.0477124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  31.11 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  28.63 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.41 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  27.49 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  29.38 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  27.94 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>