212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3100 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 306 aa  633    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  56.63 
 
 		 276 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  51.54 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  55.16 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  49.63 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  50.97 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  54.66 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  44.85 
 
 		 298 aa  244  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.54 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  49.21 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  45.91 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  49.21 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  45.91 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  48.33 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  45.91 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  49.78 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  46.06 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  48.02 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  43.36 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.78 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  49.13 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  43.13 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  47.14 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  42.75 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  47.7 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  45.77 
 
 		 283 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.79 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  49.11 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  47.06 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  46.49 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  43.95 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  40 
 
 		 391 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  43.8 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.83 
 
 		 319 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.8 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  44.1 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.56 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.15 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  40.61 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  41.36 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.7 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  30.77 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  30.05 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  30.45 
 
 		 254 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.8 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  35.81 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  30.67 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  31.37 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  31.33 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.26 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.36 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  29.89 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.42 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.8 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  28.11 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  29.27 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  28.23 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  30.77 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.86 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  29.79 
 
 		 263 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.17 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  30.43 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  26.27 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  25.48 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  32.39 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  28.17 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  28.63 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  28.28 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  30 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  25.88 
 
 		 359 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  30.62 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  29.39 
 
 		 255 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.62 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  26.16 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  30.43 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.22 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.93 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  29.96 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  27.39 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  30.66 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  30.56 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  27.39 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  29.39 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  30.66 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2252  competence lipoprotein ComL  30.09 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  28.72 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>