229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6164 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  87 
 
 		 289 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  83.17 
 
 		 301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  82.39 
 
 		 301 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  80.79 
 
 		 302 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  80.43 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  79.39 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  64.15 
 
 		 284 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  57.24 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  56.9 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  61.07 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  61.07 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  61.48 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  57.09 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  53.12 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  58.92 
 
 		 288 aa  295  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  51.87 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  55.12 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  51.49 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  50.55 
 
 		 287 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  46.85 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  53.56 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.1 
 
 		 281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.74 
 
 		 281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  49.59 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.85 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  44.52 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  43.84 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  44.76 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  44.57 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  44.49 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  42.12 
 
 		 278 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  46.67 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  45.8 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  45.23 
 
 		 302 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  46.64 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  40.3 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  46.25 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  43.16 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  40 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.43 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  33.86 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  33.98 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.55 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  32.93 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  32.81 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.96 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  30.08 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  30.21 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  32.14 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  31.58 
 
 		 341 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  30.8 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.4 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  31.58 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  29.57 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  29.28 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  29.13 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  32.42 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  30.87 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  25.78 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  29.76 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.14 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  31.08 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.52 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.12 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  30.91 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.64 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  31.12 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  30.4 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  27.2 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  27.57 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  28 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  28.86 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  28.86 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  30.77 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.77 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  30.45 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.23 
 
 		 258 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  27.01 
 
 		 235 aa  99  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  27.94 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  30.26 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  29.08 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2347  putative competence lipoprotein, ComL  30.85 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0433334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.44 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  25.68 
 
 		 359 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1840  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.85 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0444128  normal  0.143398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  26.07 
 
 		 359 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.17 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.67 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.1 
 
 		 243 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>