218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2430 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  100 
 
 		 291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  54.38 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  53.36 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  55.69 
 
 		 261 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  51.67 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.02 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  45.64 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  45.3 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.63 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  49.8 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  48.34 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  55.74 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  50 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  52.1 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  52.1 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  48.47 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  46.89 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  52.52 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  51.26 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  55.51 
 
 		 264 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  48.87 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  49.59 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  50.83 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  47.74 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  47.74 
 
 		 287 aa  262  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  49.62 
 
 		 279 aa  262  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  50 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  50.76 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  50.76 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  47.6 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  50.19 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.24 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  44.44 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.86 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  49.38 
 
 		 302 aa  251  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  47.04 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  44.19 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.77 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.02 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  42.96 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  36.07 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  34.47 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.32 
 
 		 261 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  36.32 
 
 		 251 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  36.26 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  34.74 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.66 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  35.17 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  34.14 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  33.06 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  34.51 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  32.38 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  33.61 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  33.99 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  33.9 
 
 		 339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  33.76 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  33.9 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.9 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  36 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  36 
 
 		 341 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  32.43 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  33.05 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  34.7 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.94 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.97 
 
 		 258 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  31.4 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  33.62 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  33.88 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  34.25 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  32.43 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  33.79 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  31.66 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  32.05 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  32.17 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  32.17 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  30.37 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  32.23 
 
 		 255 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.47 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  34.19 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  33.33 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.22 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  33.2 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.62 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  33.33 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  30 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  29.04 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  30.96 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  30.96 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  32.05 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  31.94 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  32.22 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.22 
 
 		 265 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  30.24 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  30.97 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  30.77 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  29.54 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  29.54 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  31.84 
 
 		 274 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>