220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1732 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  100 
 
 
268 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  74.59 
 
 
264 aa  391  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  71.71 
 
 
261 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  53.85 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  54.22 
 
 
276 aa  279  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  57.14 
 
 
291 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  51.59 
 
 
292 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  48.58 
 
 
280 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  53.77 
 
 
302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  43.94 
 
 
289 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  47.58 
 
 
278 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  47.58 
 
 
278 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  46.84 
 
 
297 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  45.88 
 
 
283 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  45.82 
 
 
279 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  44.62 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.21 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  42.8 
 
 
301 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  42.86 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 
278 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  48.6 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.6 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.46 
 
 
319 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.58 
 
 
299 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  41.92 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  41.92 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  44.21 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  42.69 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  47.66 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  42.62 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  48.83 
 
 
293 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  46.15 
 
 
298 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  42.13 
 
 
298 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  40.22 
 
 
391 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  44.6 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  44.13 
 
 
288 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.07 
 
 
281 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  44.13 
 
 
288 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.07 
 
 
281 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  40.16 
 
 
279 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  43.19 
 
 
288 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.08 
 
 
261 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  35.1 
 
 
251 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.98 
 
 
302 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  33.76 
 
 
254 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  33.19 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  30.31 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  31.15 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  30.59 
 
 
254 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  29.75 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.28 
 
 
273 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  30.93 
 
 
235 aa  115  6e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  29.41 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  28.63 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  29.6 
 
 
274 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  29.31 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  29.69 
 
 
255 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  27.71 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.28 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  28.45 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  29.02 
 
 
271 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  31.22 
 
 
268 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  31.49 
 
 
253 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.46 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  31.97 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  30.99 
 
 
281 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
266 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  27.66 
 
 
272 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  27.66 
 
 
255 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.33 
 
 
279 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2179  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.86 
 
 
268 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  27.38 
 
 
265 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.11 
 
 
258 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  31.28 
 
 
268 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  29.54 
 
 
277 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  26.42 
 
 
301 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  25.48 
 
 
268 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  25.1 
 
 
282 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.81 
 
 
289 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  25.51 
 
 
253 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  25.51 
 
 
253 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  30.33 
 
 
263 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  29.28 
 
 
300 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  26.56 
 
 
285 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  26.17 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  26.17 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  26.85 
 
 
274 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.28 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.17 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  26.17 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  25.9 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.27 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  25.22 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  25.7 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  25.81 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  25.81 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  25.3 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  26.16 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  26.16 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>