213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1999 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  100 
 
 		 288 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  67.77 
 
 		 287 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  66.67 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  66.3 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  68.08 
 
 		 288 aa  374  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  60.65 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  63.33 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  62.96 
 
 		 281 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  53.12 
 
 		 299 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  54.04 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  53.87 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  55.35 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  58.92 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  52.08 
 
 		 298 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  54.89 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  54.18 
 
 		 325 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  56.9 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  56.49 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  56.49 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  57.45 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  54.15 
 
 		 284 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  51.67 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  50.74 
 
 		 391 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  50.97 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  54.17 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  46.4 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  46.64 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  44.03 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  43.49 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  42.08 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  44.98 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.69 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  44.92 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  44.92 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  41.85 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  47.6 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  41.7 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  44.13 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  43.28 
 
 		 264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  39.5 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  34.54 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  31.67 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  30.29 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  29.48 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  32.46 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  32.46 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  30.71 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.51 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  30.92 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  30.91 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  29.96 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  30.52 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.96 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  29.96 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.64 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  30.27 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  29.25 
 
 		 235 aa  117  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  31.15 
 
 		 261 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  31.82 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  31.02 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  29.13 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  26.21 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  27.9 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  31.15 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  29.51 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  28.52 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  29.06 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  29.06 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  33.18 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  27.95 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  26.19 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  27.62 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.5 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1126  putative lipoprotein (DUF0169)  26.59 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.926748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.04 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  27.54 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1325  competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.028744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.24 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.54 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  27.13 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.04 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1814  competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.861802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0082  competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2169  putative competence lipoprotein ComL  28.94 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1085  competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0185202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  29.73 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.5 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2334  competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2206  putative competence lipoprotein ComL  30.33 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>