214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2348 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  100 
 
 
293 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  79.93 
 
 
291 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  79.93 
 
 
291 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  82.4 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  73.74 
 
 
299 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  72.82 
 
 
298 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  56.51 
 
 
391 aa  331  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  57.84 
 
 
302 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  55.27 
 
 
325 aa  315  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  55.48 
 
 
289 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  55.56 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  58.66 
 
 
288 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  59.35 
 
 
297 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  59.02 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  55.15 
 
 
301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  54.41 
 
 
284 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  50.92 
 
 
287 aa  281  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  50.92 
 
 
287 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  54.81 
 
 
288 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  50 
 
 
287 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  47.18 
 
 
289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  51.05 
 
 
291 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  49.07 
 
 
281 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  50.19 
 
 
288 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  48.7 
 
 
281 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  45.27 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.96 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  44.69 
 
 
279 aa  232  6e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  44.61 
 
 
280 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  43.96 
 
 
292 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  42.65 
 
 
283 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  48.17 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  41.52 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  50.23 
 
 
264 aa  215  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  44.21 
 
 
278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  48.83 
 
 
268 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.8 
 
 
319 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  41.04 
 
 
279 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  44.84 
 
 
315 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  43.57 
 
 
302 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.37 
 
 
302 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  35.04 
 
 
250 aa  149  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  35.04 
 
 
254 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  31.6 
 
 
253 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  32.56 
 
 
254 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  31.33 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.51 
 
 
273 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  29.84 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  29.96 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  27.94 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  27.2 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  30.91 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  31.94 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  32.82 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.82 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.73 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
266 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  29.67 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.18 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  28.57 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  30.04 
 
 
271 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  29.96 
 
 
268 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.68 
 
 
285 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
265 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.13 
 
 
258 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  30 
 
 
293 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  29.83 
 
 
268 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  30.13 
 
 
300 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  29.55 
 
 
293 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  30.28 
 
 
339 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  30.17 
 
 
338 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.73 
 
 
243 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.28 
 
 
339 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  27.8 
 
 
255 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.73 
 
 
243 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.73 
 
 
243 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  27.92 
 
 
272 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  27.56 
 
 
295 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  30.28 
 
 
339 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  29.82 
 
 
339 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.31 
 
 
243 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.13 
 
 
265 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  27.13 
 
 
252 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  28.83 
 
 
277 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2876  putative transmembrane protein  29.64 
 
 
284 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.676791 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0922  putative transmembrane protein  29.72 
 
 
295 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.357756  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1258  lipoprotein  26.56 
 
 
359 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3160  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.38 
 
 
289 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  30.57 
 
 
341 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  30.57 
 
 
341 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  28.74 
 
 
274 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  28.1 
 
 
340 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  28.4 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  27.84 
 
 
337 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  27.68 
 
 
253 aa  99  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  28.72 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  27.52 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  26.09 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>