More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4899 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
246 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0170  tetratricopeptide repeat domain protein  32.37 
 
 
195 aa  67  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0605365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  37.89 
 
 
643 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  39.32 
 
 
579 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.3 
 
 
810 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  30.34 
 
 
299 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
523 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
1005 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2456  putative aerotolerance-related exported protein BatC containing TPR domain  28.57 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
657 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1252  putative lipoprotein  20.78 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.360764  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  35.64 
 
 
573 aa  58.9  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
878 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.89 
 
 
560 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
635 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
611 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
635 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
3035 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0440  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0275191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 
547 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  31.58 
 
 
661 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
588 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 
1034 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.54 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  33.58 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  34.91 
 
 
1154 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
639 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
296 aa  56.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 
871 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
688 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.86 
 
 
1694 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
637 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
644 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.53 
 
 
764 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
750 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  27.21 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
3560 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
789 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
543 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
711 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
602 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
828 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  35.24 
 
 
576 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
833 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  39.32 
 
 
503 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
636 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
617 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
3172 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
828 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
612 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
754 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
313 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.08 
 
 
1007 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
465 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.86 
 
 
887 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
701 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
188 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.43 
 
 
622 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 
626 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 
626 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.98 
 
 
818 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
614 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 
1979 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  26.95 
 
 
471 aa  52.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 
614 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 
614 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
614 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21931  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 
465 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
718 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  41.46 
 
 
701 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
614 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  32.04 
 
 
564 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.55 
 
 
1056 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
188 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 
754 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
573 aa  52  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
689 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  33.59 
 
 
690 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  28.57 
 
 
338 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
681 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
512 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
605 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  32.29 
 
 
407 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
744 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.85 
 
 
725 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>