More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0905 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.1 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  31.83 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  30.74 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 878 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 3035 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  33.65 
 
 		 887 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 1737 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  33.05 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 3560 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.54 
 
 		 632 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 4489 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.06 
 
 		 742 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.73 
 
 		 764 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 685 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.58 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.42 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.46 
 
 		 622 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 605 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1094 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1127 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.56 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 657 aa  55.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 4079 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 766 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 1061 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.02 
 
 		 875 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1276 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 649 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 612 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  33.67 
 
 		 425 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 649 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 		 1694 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.97 
 
 		 707 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  29.9 
 
 		 407 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 573 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 761 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 909 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 405 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1005 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1909  aerotolerance protein  23.53 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.12502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 892 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 486 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 594 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0440  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0275191  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 542 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  36 
 
 		 530 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.13 
 
 		 1240 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 626 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 614 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 626 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 614 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 762 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.61 
 
 		 703 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 562 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 614 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 614 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.46 
 
 		 626 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 173 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 614 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 3172 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 615 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.68 
 
 		 566 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 739 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 512 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  29.19 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 		 344 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 646 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.31 
 
 		 832 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>