16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2350 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2115  hypothetical protein  32.56 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463598  normal  0.981842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0216  hypothetical protein  28 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2461  hypothetical protein  29.67 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0105  hypothetical protein  27.84 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2301  hypothetical protein  25.99 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000581603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  27.33 
 
 		 897 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.1 
 
 		 622 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0055  hypothetical protein  34.67 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.97 
 
 		 764 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1094 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2668  Tetratricopeptide repeat protein  27.27 
 
 		 230 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121985  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0440  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0275191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>