125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1483 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.89 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  42.52 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  30.93 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  31.08 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.96 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 878 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2456  putative aerotolerance-related exported protein BatC containing TPR domain  26.14 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 766 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  23.23 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.87 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.17 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 612 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 657 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.34 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0440  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.38 
 
 		 703 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 486 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 		 875 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  39.06 
 
 		 690 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 637 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 1737 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2461  hypothetical protein  27.78 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  24.18 
 
 		 585 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 681 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 594 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.25 
 
 		 764 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 714 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 3035 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.31 
 
 		 795 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 622 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 4489 aa  49.3  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.25 
 
 		 887 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 685 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 864 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 416 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 649 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.19 
 
 		 1694 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 649 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 374 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 3560 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 754 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 754 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0723  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.423788  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 4079 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  29.23 
 
 		 1677 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 714 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  30.08 
 
 		 425 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 543 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1094 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2437  hypothetical protein  20.52 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 3172 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  31.03 
 
 		 681 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 833 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.58 
 
 		 740 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 435 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  34.18 
 
 		 651 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 517 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 828 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  34.72 
 
 		 529 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 824 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 870 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  27.22 
 
 		 531 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 828 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 626 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 1034 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 472 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 311 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 646 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  32.48 
 
 		 1180 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1406 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2350  hypothetical protein  27.05 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 397 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  27.5 
 
 		 773 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.19 
 
 		 816 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 789 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1127 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 344 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 762 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 833 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 620 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>