63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0721 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 258 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  38.36 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.71 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  42.76 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  36.57 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.68 
 
 		 714 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 700 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0440  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0275191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.59 
 
 		 810 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 878 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 576 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2350  hypothetical protein  28.92 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 657 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 594 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 		 992 aa  48.5  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  38.03 
 
 		 622 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32 
 
 		 887 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 		 595 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 701 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 637 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 649 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 649 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  38.03 
 
 		 764 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  36.62 
 
 		 340 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 762 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 3172 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 646 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 1252 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 644 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 		 3301 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 1737 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  35.38 
 
 		 979 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 3560 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 556 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 1252 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 587 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.34 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 833 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 320 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1073 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 681 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 573 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.25 
 
 		 730 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1005 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 4489 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1212 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 828 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 828 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 750 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5482  Tetratricopeptide domain protein  26.21 
 
 		 239 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 364 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 523 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>