217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1949 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
612 aa  1209    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
647 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 
572 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
588 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  34.37 
 
 
658 aa  293  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
572 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
571 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  36.7 
 
 
572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  39.27 
 
 
577 aa  277  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  36.23 
 
 
572 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
664 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  32.63 
 
 
667 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  37.14 
 
 
578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
644 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  36.81 
 
 
579 aa  266  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  34.72 
 
 
607 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  37.66 
 
 
586 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
663 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  39.28 
 
 
585 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
701 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 
679 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
650 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.66 
 
 
690 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 
692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
690 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.8 
 
 
692 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
522 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
690 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.49 
 
 
619 aa  224  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
653 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
693 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  30.46 
 
 
646 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
681 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
687 aa  220  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  32.24 
 
 
601 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  34.56 
 
 
701 aa  217  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
693 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.57 
 
 
599 aa  211  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 
680 aa  211  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
587 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  31.08 
 
 
544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
612 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.3 
 
 
576 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.14 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.94 
 
 
531 aa  180  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
533 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.3 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
573 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  29.78 
 
 
573 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
573 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.1 
 
 
503 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.57 
 
 
595 aa  127  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  32.58 
 
 
310 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  32.58 
 
 
310 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
611 aa  107  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  21.39 
 
 
471 aa  104  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.45 
 
 
564 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  28.71 
 
 
651 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
298 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
345 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 
273 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
301 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 
347 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30 
 
 
335 aa  84  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 
339 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  32.14 
 
 
304 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 
312 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 
337 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 
320 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
312 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  36.22 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  35.66 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  29.81 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  33.18 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
589 aa  77  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.32 
 
 
346 aa  77  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
343 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
220 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  31.86 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  27.76 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 
344 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
306 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  29.63 
 
 
320 aa  66.6  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 
349 aa  66.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
337 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
339 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  32.02 
 
 
334 aa  63.9  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.46 
 
 
330 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  29.89 
 
 
299 aa  61.6  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 
338 aa  61.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
344 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  28.37 
 
 
333 aa  60.1  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>