115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1537 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  38.61 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.87 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  46.55 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  37.24 
 
 		 247 aa  85.9  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3035 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 878 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.67 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 		 595 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 3560 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 810 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 638 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 657 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 534 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 650 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  39.08 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.17 
 
 		 887 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  29.69 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.57 
 
 		 681 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 714 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0902999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0140  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.207647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 766 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1212 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 579 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 654 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 639 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.95 
 
 		 864 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 416 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.53 
 
 		 714 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.26 
 
 		 733 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1714 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 4489 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  36.78 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.62 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 637 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 1276 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 1737 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 711 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2456  putative aerotolerance-related exported protein BatC containing TPR domain  26.29 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.85 
 
 		 832 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1038 aa  45.8  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 392 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 740 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 612 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 622 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  33.66 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  29.7 
 
 		 607 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1565  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10215  peroxisomal targeting signal (PTS1) receptor protein peroxin 5 (Eurofung)  30.95 
 
 		 655 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000612411  normal  0.654696 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  35.9 
 
 		 750 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.29 
 
 		 992 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 583 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  31.91 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1127 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 587 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 611 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1005 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  30.47 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 685 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 		 589 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 635 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 466 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 635 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 562 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 549 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 644 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 1073 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.57 
 
 		 1013 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 637 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 		 875 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 1061 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 576 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01940  karyogamy-related protein, putative  26.44 
 
 		 886 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  19.72 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.13 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 681 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 594 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 542 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 399 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.56 
 
 		 1000 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>