92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2082 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  72.96 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  67.86 
 
 		 314 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  59.27 
 
 		 285 aa  351  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  57.43 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  45.96 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.88 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 254 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  32.4 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  25.21 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.14 
 
 		 988 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 		 1056 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.74 
 
 		 1056 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 792 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.54 
 
 		 1022 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.41 
 
 		 818 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 784 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  26.56 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 3145 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 		 453 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 1073 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1371 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.86 
 
 		 586 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  26.46 
 
 		 451 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 718 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 451 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 454 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 833 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.71 
 
 		 689 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 		 624 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  25.56 
 
 		 542 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.27 
 
 		 673 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 601 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 366 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 670 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.45 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 593 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 878 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 639 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 626 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 626 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 883 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 866 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 614 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 875 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 611 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 614 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 614 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 614 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 614 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 602 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0650  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.52 
 
 		 725 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 597 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  29.46 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.36 
 
 		 462 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.63 
 
 		 924 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 605 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.03 
 
 		 561 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.03 
 
 		 561 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  19.21 
 
 		 810 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 409 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  29.57 
 
 		 630 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  18.57 
 
 		 1121 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.2 
 
 		 733 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.25 
 
 		 882 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1161 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0680  type 4 fimbrial biogenesis protein  27.5 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  26.61 
 
 		 656 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 		 758 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>