38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0931 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  35.66 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  29.52 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  30.52 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  30.99 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  36.29 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.85 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  26.25 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 453 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 754 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 754 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.78 
 
 		 733 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 417 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1421 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 597 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  31.01 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.42 
 
 		 725 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.75 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 363 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 792 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 718 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  37.14 
 
 		 703 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 643 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 762 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 748 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 700 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 277 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 350 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>