16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0393 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  28.1 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  26.14 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  28.49 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 267 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>