25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2215 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 237 aa  477  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.29 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 314 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  26.02 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  24.29 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  25.73 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  26.99 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  22.89 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.51 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 870 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.31 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  26.32 
 
 		 435 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0143  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.279427  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.18 
 
 		 850 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0614  Tetratricopeptide domain protein  32.89 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.49 
 
 		 747 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1452  hypothetical membrane associated protein  25.76 
 
 		 517 aa  42  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>