80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2904 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
261 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  59.76 
 
 
302 aa  329  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  57.83 
 
 
314 aa  325  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  57.96 
 
 
285 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  50.41 
 
 
285 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  45.95 
 
 
301 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.81 
 
 
265 aa  204  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
250 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
254 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  30.98 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 
294 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
253 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
237 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  29.1 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  26.14 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  30.72 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
792 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
3145 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  32.58 
 
 
451 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.22 
 
 
810 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
194 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
3172 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 
453 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.57 
 
 
3301 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.69 
 
 
882 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 
576 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
454 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.84 
 
 
875 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 
689 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
750 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
718 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
878 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.92 
 
 
882 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.98 
 
 
462 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
1056 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 
988 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  51.22 
 
 
451 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.73 
 
 
1056 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
818 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
476 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  30.3 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
1371 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
4079 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.58 
 
 
466 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
602 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
866 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  21.69 
 
 
1073 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  29.41 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 
1838 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
566 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
1038 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
565 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 
1116 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 
586 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
795 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1252 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.52 
 
 
816 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1252 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
566 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
828 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.09 
 
 
883 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24 
 
 
733 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
556 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
399 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
828 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
605 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.62 
 
 
456 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  29.13 
 
 
573 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
311 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
542 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.68 
 
 
725 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  26.05 
 
 
538 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
262 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.56 
 
 
626 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>