93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1136 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 302 aa  624  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  72.96 
 
 		 285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  65.41 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  58.18 
 
 		 285 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  59.76 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  46.43 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.7 
 
 		 265 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  28.1 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 3145 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 1073 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  24.85 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 		 453 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  25.74 
 
 		 422 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 792 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 718 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1827 aa  52.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  27.75 
 
 		 451 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 454 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 		 784 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1371 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 409 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.49 
 
 		 1022 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 586 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 3172 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 		 3301 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 565 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.27 
 
 		 673 aa  49.3  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.5 
 
 		 1056 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 4079 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  32.22 
 
 		 451 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  30.17 
 
 		 725 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 689 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 776 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.83 
 
 		 818 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 670 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.84 
 
 		 1056 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 597 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 592 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1161 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 456 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 605 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 589 aa  45.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.79 
 
 		 988 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  20.53 
 
 		 810 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 715 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.72 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 		 1252 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.43 
 
 		 878 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 		 1252 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.7 
 
 		 626 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.7 
 
 		 626 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.68 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.35 
 
 		 676 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.7 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.7 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 614 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47766  predicted protein  25.85 
 
 		 613 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  34.04 
 
 		 816 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 878 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 795 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.39 
 
 		 733 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.69 
 
 		 587 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 3035 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 761 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27.34 
 
 		 648 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  24.66 
 
 		 630 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 601 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1106 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 349 aa  42.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 866 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.04 
 
 		 561 aa  42.4  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04620  co-chaperone, putative  28.38 
 
 		 522 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 566 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>