25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2790 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 237 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  25.19 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2761  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  27.78 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  23.22 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  23.67 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1452  hypothetical membrane associated protein  27.08 
 
 		 517 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 267 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 870 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 1486 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 		 850 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  40 
 
 		 533 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 781 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  32.94 
 
 		 708 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>