More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0132 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 3035 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 878 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.96 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  31.53 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 715 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 602 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.92 
 
 		 864 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1094 aa  55.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.26 
 
 		 810 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 486 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  32.26 
 
 		 430 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 3172 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 543 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1005 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 1486 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  30.39 
 
 		 676 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 1034 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 596 aa  52.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 		 2240 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1276 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 660 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 750 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.98 
 
 		 561 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 3301 aa  52.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1085 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3560 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 955 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.98 
 
 		 1056 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 614 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 2651 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 542 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.98 
 
 		 561 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.19 
 
 		 887 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  33.94 
 
 		 566 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 836 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.18 
 
 		 816 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 599 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 1252 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 560 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  32.32 
 
 		 865 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  31.91 
 
 		 566 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 589 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  24.6 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 465 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  22.82 
 
 		 1101 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 574 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 612 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 1252 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.87 
 
 		 820 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 476 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 390 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 4079 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  32.14 
 
 		 2679 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  34.69 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  25.23 
 
 		 631 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 1406 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 708 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 927 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 		 689 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.58 
 
 		 623 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.57 
 
 		 739 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 592 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 448 aa  49.3  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 4489 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 685 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 697 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 350 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 968 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 621 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  31.13 
 
 		 587 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 833 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>